ARNr 16S como herramienta aplicada en la caracterización molecular de géneros y especies de bacterias
16S rRNA as an applied tool in the molecular characterization of genera and species of bacteria
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Suárez-Contreras, L. Y. ., & Yañez-Meneses , L. F. . (2020). ARNr 16S como herramienta aplicada en la caracterización molecular de géneros y especies de bacterias. Respuestas, 25(1), 127–137. https://doi.org/10.22463/0122820X.2430
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Resumen
La identificación bacteriana se realiza por medio de métodos convencionales basados en las características fenotípicas, puesto que su realización y costos son de más fácil acceso, sin embargo, la identificación molecular permite conocer la verdadera identidad del género y la especie. Se realizó la identificación molecular de 24 cepas de bacterias conservadas en el Banco de Cepas de la Universidad Francisco de Paula Santander, Centro Experimental Campos Eliseos, identificadas bajo criterios fenotípicos macroscópicos y microscópicos. Inicialmente se reactivaron las cepas conservadas en solución salina y se caracterizaron macro y microscópicamente, luego se realizó extracción de ADN y se procedió hacer PCR para amplificar la región ARNr 16S permitiendo tener acceso a la secuencia de ADN de interés; las muestras se enviaron a secuenciar y por medio de herramientas bioinformáticas se conoció la identidad de cada bacteria. Las cepas: BLB003, BLB009, BLB011, BLB012, BLB014, BLB016, BLB018, BLB022, BLB023, BLB024, BLB033, se identificaron como Bacillus cereus; BLB010 como Bacillus thurigiensis; mientras que BLB030, BLB031, BLB032, como Bacillus pumilus; BLB020 como Bacillus amyloliquefaciens; BLB001, BLB004, BLB007, y BLB037, conformaron el grupo de Bacillus subtilis; y es posible que existan ramificaciones divergentes entre especies de Bacillus en arboles filogeneticos. Otra agrupación que se observó en el arbol filogenetico son las cepas BLB019 y BLB029 que corresponden a Achromobacter xylosoxidans y Alcaligenes faecalis respectivamente. También otro grupo BLB013 y BLB017, fueron identificadas como Stenotrophomonas maltophilia. Es importante tener en cuenta que en ocasiones el ARNr 16S presenta una baja capacidad de discriminación para algunos géneros y especies debido a recientes divergencias, es necesario complementar la identificación con el estudio de otros genes.
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